Labmedya - Laboratuvar ve Sağlık Gazetesi

Kronik bir yara yaşayacaktır. Şiddetli ağrıya ek olarak, kronik yaraları olan kişiler durumun kalıcı doğası ve tekrarlama riski nedeniyle ruh sağlığı sorunlarıyla karşı karşıya kalabilirler. Bu, yaşam kalitelerini önemli ölçüde etkiler ve etkili tedavilere olan ihtiyacı vurgular.

Bu karşılanmamış klinik ihtiyaç göz önüne alındığında , araştırmacılar yeni bir sınırı keşfetmeye başladılar : yara mikrobiyomu. Pennsylvania Üniversitesi’nde Elizabeth Grice’ın araştırma ekibinde mikrobiyolog olan Ellen White , daha önce yayınlanan çalışmaların büyük ölçüde , bozulmuş iyileşmeye katkıda bulunan cilt hücrelerindeki hatalı süreçlere odaklandığını söyledi. « Ancak son zamanlarda, yaraları kolonize eden ve yara iyileşmesini etkileyebilen bütün bir ekosistem olan bir yara mikrobiyomunun varlığını fark ettik. 

Bunu vurgulayan White ve meslektaşları, kronik yaralarda bulunan bir bakterinin farelerde yara iyileşmesine yardımcı olabileceğini gösterdiler . Science Advances’ta yayınlanan sonuçlar , bakteri kaynaklı yara onarımının bir mekanizmasını ortaya çıkarıyor ve mikrobiyom tabanlı tedaviler geliştirmek için bir temel sağlıyor.

Miami Üniversitesi Miller Tıp Fakültesi’nde cilt rahatsızlıklarında mikrobiyom etkileşimleri üzerine araştırmalar yapan ve çalışmaya dahil olmayan Irena Pastar , « Bu çalışma, kronik yara mikrobiyomunun iyi tarafına ışık tutması açısından benzersizdir » dedi.

Kronik yara ilişkili mikrobiyotayı tanımlamak için Grice’ın ekibi 100 katılımcıdan diyabetik ayak ülseri örneği aldı ve bu örneklerden DNA dizilimi yaptı. Örneklerde bol miktarda bulunan bakteriler arasında Alcaligenes faecalis adı verilen çevresel, patojenik olmayan bir bakteri tanımladılar. Yayınlanmış veri kümelerini inceleyen ekip, bu bakterinin bası yaraları ve venöz bacak ülserleri gibi farklı kronik yara tiplerinde yaygın olduğunu buldu. Bu, onları kronik yaralarda A. faecalis’in rolünü araştırmaya yöneltti .

Ekip deneyleri için yara iyileşmesi bozulmuş diyabetik bir fare modeli kullandı. Bu farelerin sırt derisinde yaklaşık sekiz milimetre çapında yaralar açtılar ve bunları A. faecalis kültürüyle tedavi ettiler. Bu yaraları farklı zamanlarda fotoğrafladılar ve A. faecalis ile kolonize olan yaraların kontrol solüsyonuyla tedavi edilen yaralardan önemli ölçüde daha küçük olduğunu gözlemlediler.

A. faecalis'in yara iyileşmesini nasıl etkilediğini daha iyi anlamak için araştırmacılar, bakterinin yara iyileşmesinin erken evrelerinde dış deri tabakasında gerçekleşen önemli bir süreç olan hücre göçünü teşvik edip etmediğini araştırmak için in vitro deneyler kullandılar.

Diyabetli farelerden, cildin en dış tabakasındaki hücreler olan keratinositleri izole ettiler ve bunları laboratuvar kaplarında kültüre ettiler. Hücreler kapta bir tabaka oluşturduğunda, araştırmacılar ortada ince bir çizik oluşturarak hücrelerin sürekli katmanını bozdular. Sistemi A. faecalis veya bir kontrol solüsyonuyla tedavi ettiler ve bozulmamış taraftaki hücrelerin boş alanı doldurmak için çiziklere doğru ne kadar hızlı hareket ettiğini izlemek için zaman içinde fotoğraflar çektiler. Kontrolle tedavi edilen hücrelerle karşılaştırıldığında, A. faecalis tedavisi keratinositlerin göç etme hızını artırdı. Bu deneyi diyabetli insanlardan alınan cilt hücreleriyle tekrarladıklarında benzer sonuçlar gözlemlediler ; bu da bakterinin muhtemelen insanlarda benzer bir mekanizma yoluyla yara iyileşmesini etkilediğini gösteriyor.

A. faecalis'in keratinosit göçünü nasıl desteklediğine dair fikir edinmek için araştırmacılar, A. faecalis ile tedavi edilen diyabetli farelerden yaralar topladılar ve dokudan RNA dizilediler. Tedavi edilmeyen dokuyla karşılaştırıldığında, A. faecalis ile tedavi edilen yaralar birkaç genin ifadesinde azalma gösterdi. Genler en önemli şekilde hücrelerin hücre dışı matrisini parçalayan enzimler olan kodlanmış matris metalloproteinazları (MMP’ler) aşağı düzenledi. Önceki çalışmalar, yara kenarına yakın keratinositlerin MMP’leri ifade ettiğini ve bunun bu hücrelerin iyileşmesine yardımcı olmak için yaralara doğru göç etmesine yardımcı olduğunu göstermiştir. Ancak, diyabetik durumlar yara iyileşmesine zararlı olan aşırı MMP ifadesini teşvik eder .

Diyabetik farelerden alınan yara dokusunun immünofloresan analizleri, yara kenarına yakın bir MMP’nin yüksek ekspresyonunu ortaya koydu ; bu, A. faecalis tedavisinin ardından azaldı. A. faecalis ile tedavi edilen yaralara MMP’ler eklenmesi, bunların bakteri ile tedavi edilmeyen yaralara benzer şekilde davranmasıyla sonuçlandı ve A. faecalis’in pro-iyileştirici özelliklerine yara bölgesindeki MMP’leri düşürerek ulaştığını doğruladı .

White, bu beklenmedik bulgular karşısında heyecanlandı ve ekledi, « Başlangıçta iyileşmeyi destekleyen bakteriler bulmak için yola çıkmadık. » Bu sonuçlar yara mikrobiyomu hakkında yeni bir bakış açısı sunuyor. White, « Çoğu yara sonunda iyileşiyor, bu da tüm bakteri kolonizasyonunun kötü olmadığı anlamına geliyor. Ayrıca, yara tedavileri için kullanabileceğimiz bazı yararlı bakteriler de var, » dedi.

Pastar, « Sonuçlar, kronik yara ortamından patojenleri ortadan kaldırmak için daha az agresif antimikrobiyal yaklaşımlar kullanırken dost bakterileri nasıl koruyacağımızı düşünmemiz gerektiğini gösteriyor » dedi.

Pastar, gelecekteki çalışmaların A. faecalis tarafından salgılanan pro-iyileştirici faktörleri belirlemeye ve bunları klinik deneylerde test etmeye odaklanabileceğini söyledi. Cilt , her biri ve ciltteki farklı hücre tipleriyle iletişim kuran çok sayıda bakteri türüyle doludur. « Bu nedenle, A. faecalis’in engellenmiş yara iyileşmesinin başlıca suçlularıyla nasıl etkileşime girdiğini görmek klinik uygulamayı iyileştirecektir » diye açıkladı.

White da aynı fikirde. « Mikrop arasındaki etkileşim muhtemelen resmin gerçekten önemli bir parçası, » dedi. « Ancak bu toplum çapındaki resme sahip olmak için, aynı zamanda bireysel mikropları daha iyi anlamamız gerekiyor, » diye ekledi.

Yazar: Bassma Bouanani

Kaynakça: https://www.the-scientist.com/detecting-novel-viruses-using-a-comprehensive-enrichment-panel-72533