Labmedya - Laboratuvar ve Sağlık Gazetesi

SARS-CoV-2 enfeksiyonundan sonra bütün bir fare göğsü yukarıda gördüğünüz HYBRiD görselleştirmesi ile viral protein kırmızı ve doku yapıları (akciğer, kan damarı, kemik) mavi olarak gösterilmektedir. Kaynak: Scripps Research.

Scripps Research'ten bilim insanları, büyük biyolojik örnekleri şeffaf hale getirmek için yeni bir doku temizleme yöntemi açıkladılar. Yöntem, bilim insanlarının çoklu organ sistemlerinde meydana gelen sağlıklı ve hastalıkla ilgili biyolojik süreçleri görselleştirmesini ve incelemesini her zamankinden daha kolay hale getiriyor.

Nature Methods'da yayınlanan ve HYBRiD olarak adlandırılan bir makalede açıklanan yeni yöntem, doku temizleme teknolojisine yönelik önceki iki ana yaklaşımın unsurlarını birleştiriyor ve büyük numune uygulamalarından daha pratik ve ölçeklenebilir gözükmektedir.

Araştırmanın kıdemli yazarı ve Scripps Research’ün nörobilim dalından Doç. Li Ye, “Bu, büyük vücut parçalarının ve hatta tüm hayvanlar üzerinde yapılacak olan çalışmaları için basit ve evrensel bir doku temizleme tekniğidir” dedi.

Doku temizleme, dokuyu opak yapan (yağ gibi) molekülleri uzaklaştırmak için çözücülerin kullanımını içerir ve dokuyu optik olarak şeffaf hale getirirken çoğu proteini ve yapıyı yerinde tutar. Bilim insanları, bir laboratuvar hayvanında aktif genleri veya diğer ilgilenilen molekülleri işaretlemek için yaygın olarak genetik olarak kodlanmış veya antikora bağlı floresan işaretçileri kullanırlar. Ayrıca prensipte doku temizleme, bu işaretlerin hayvanın tamamında bir kerede görüntülenme yapılmasına izin verir.

Bilim insanları, esas olarak beyindeki tüm sinir bağlantılarını izlemek amacıyla yaklaşık 15 yıl önce doku temizleme yöntemleri geliştirmeye başlamıştılar. Yöntemler beyin için iyi olsa da çözülmesi daha zor yapılar içeren diğer vücut bölümlerine veya tüm vücuda uygulandığında o kadar iyi çalışmıyorlardı.

Bu yöntemler şimdiye kadar ya organik çözücüler ya da su bazlı çözücüler kullanmıştır. İlki genellikle daha hızlı ve güçlü çalışır, ancak floresan sinyallerini azaltma eğilimindedir. Su bazlı çözücüler kullanan yöntemler, floresanı korumada daha iyidir, ama beyin dışı dokuları temizlemek için pratik olarak zayıftır. Ek olarak, her iki yöntem türü de genellikle tehlikeli kimyasallar kullanan külfetli, yoğun emek isteyen prosedürler gerektirmektedir.

Ye ve ekibi tarafından geliştirilen yeni yöntem, organik çözücüler ve su bazlı deterjanların sıralı bir kombinasyonunu ve doku içindeki korunması gereken molekülleri korumak için su bazlı hidrojelleri kullanmaktadır. Bu, genellikle çözücülerin numuneden pompalanmasını gerektirmiyor.

Araştırmacılar, çeşitli uygulamalarda yeni yöntemlerinin kolaylığını ve faydasını gösterdiler. Bunlar, SARS-CoV-2 ile enfekte olmuş hücreleri tüm fare göğüsünde ilk kez görüntüleme yapmak için immünoloji ve mikrobiyolojide Doçent John Teijaro'nun laboratuvarı ile bir işbirliğini içeriyordu. Yeni yöntemle basitliği olan bu prosedür, ekipmanlara erişimin kesinlikle sınırlı olduğu üst düzey bir biyogüvenlik tesisinde yapılabilmesini sağladı.

Ye ve ekibi şu anda vücuttaki sinir yollarının izlenmesi de dâhil olmak üzere yeni yöntemin birden fazla uygulaması üzerinde çalışıyor.

Makale:

https://www.nature.com/articles/s41592-022-01427-0