Page 60 - LabMedya - 78

60 BİYOLOJİ

DNA

ONARIM

MEKANİZMASI

Alper DEMİREZEN

Cell dergisinde 16 Mayıs'ta yayımlanan ve internet gelmesinin yolunu açıyor. Kusurlu DNA daha sonra NER tarafından çıka- bulduğu önemli bir gizem olmuştur.
üzerinden erişime açılan çalışma, belirli bir moleküler rılır ve tam bir kopyası ile değiştirilir. Canlı bakterilerde, RNA polimerazın
yapı taşı sınıfı olan ribonükleotidlerin genetik kodlara Yeni bir etkisi olmadan gerçekleşen çok az NER vardır. RNaseHII ve RNA polimerazın canlı bakteri hücrelerinde
yanlış yerleştirilmesini önleyen bir DNA onarım yolunun çalışma, bakteri etkileşime girdikleri kritik arayüzler, araştırmacılar tara-
altında yatan moleküler süreci açıklıyor. Bu hatalar Cell dergisinde yayımlanan mevcut çalışma, RER'in tıpkı NER yolunda fından 2022'deki çalışmalarında yaptıkları gibi kantitatif
sıklıkla bakteriler ve diğer canlılar kod kopyalarken hücrelerinin olduğu gibi transkripsiyonla güçlü bir şekilde bağlantılı olduğuna dair kütle spektrometrisi ve in vivo protein-protein çapraz
ortaya çıkar. Tüm hayvanlarda ribonükleotid eksizyon hasarlı DNA'yı ilk kanıtı sunuyor. Çalışmanın yazarları, RNA polimerazın, aktif bakteri bağlama kullanılarak tanımlandı. Çoğu RNaseHII mo-
onarımı (RER) olarak adlandırılan ve bu tür hataları hızla hücrelerinin DNA zincirlerinde yanlış birleşmiş ribonükleotidleri aramak lekülünün RNA polimeraz ile bu şekilde bağlandığını
düzelten evrimsel bir DNA onarım sistemi vardır, çünkü sürekli olarak için önemli RER enzimi RNaseHII ile birlikte çalıştığının kanıtını keşfetti. keşfettiler.
ribonükleotidlerin yanlış yerleştirilmesi zarar verici DNA nasıl onardığına
kodu değişikliklerine (mutasyonlara) ve DNA kırılmalarına Howard Hughes Tıp Enstitüsü'nde araştırmacı olan Nudler'a göre, Buna ek olarak, kriyojenik elektron mikroskobu (CryoEM)
yol açabilir. dair gelişmekte "sonuçlarımız DNA onarımı alanındaki bazı temel ilkelerin yeniden dü- kullanarak RNA polimeraza bağlı RNaseHII'nin yüksek

DNA'da herhangi bir anormallik olup olmadığını kontrol edip etmediğini
karakterize eden protein-protein etkileşimlerini ortaya
NYU Langone Health Biyokimya ve Moleküler Farma- olan, tamamen şünülmesine ilham vermeye devam ediyor." Ekibimiz, RNA polimerazın çözünürlüklü yapılarını yakaladılar ve RER kompleksini
koloji Bölümü'nde Julie Wilson Anderson Profesörü yeni bir anlayışı ve bakterilerin yanı sıra insan hücrelerinde de genom çapında onarım çıkardılar. Dahası, RER, RNA polimeraz ve RNaseHII
olan Evgeny Nudler yönetimindeki bir ekip tarafından başlatıp başlatmadığını incelemeye devam edeceğini ifade etmiştir. arasındaki bağlantıyı azaltan yapı güdümlü genetik
aktif E. coli hücrelerinde DNA onarımı üzerine yapılan genişletiyor. çalışmalardan zarar gördü.
iki çalışma geçen yıl yayınlandı. UV ışınlarının yol açtığı EN ILERI TEKNIKLER
hasarlar da dahil olmak üzere bazı DNA hasarlarının Nudler'in laboratuvarında doktora sonrası araştırmacı
(büyük lezyonlar) büyük ölçüde onarılabildiğini, çünkü DNA'yı oluşturan deoksiribonükleotidler ve RNA'yı oluşturan ribonük- olan Zhitai Hao, çalışmanın baş yazarıdır. "Bu çalışma,
hasarlı kod parçalarının RNA polimeraz olarak bilinen bir leotidler birbirleriyle ilişkili maddelerdir. Çalışmanın yazarlarına göre, RNaseHII'nin DNA boyunca hareket ederken RNA polime-
protein makinesi tarafından zaten tanındığını keşfettiler. deoksiribonükleotidler ve ribonükleotidler sadece bir oksijen atomu razın üzerine binerek yanlış yerleştirilmiş ribonükleotidler
DNA zinciri boyunca ilerlerken RNA polimeraz, talimatları ile farklılık gösterdiğinden, bakteri hücreleri DNA zincirlerini kopyalayıp için DNA'yı taradığı bir modeli destekliyor" diye ekliyor. Bu
RNA moleküllerine dönüştürmek için DNA "harflerinin" oluştururken ribonükleotidler sıklıkla DNA zincirlerine yanlış bir şekilde araştırma, DNA onarımına ilişkin temel anlayışımızı ilerlet-
kodunu okur ve daha sonra proteinlerin sentezini sağlar. dahil edilmektedir. DNA polimeraz III bir hücrenin genetik materyalini her mek için çok önemlidir ve önemli klinik sonuçları vardır.
kopyaladığında, bakteri hücrelerinde bu hatalardan yaklaşık 2.000 ta-
Nudler ve meslektaşlarının araştırmasına göre, RNA po- nesini yaptığı bilinmektedir. Yanlış yerleştirilmiş ribonükleotidlerin çoğu, Kaynaklar: https://phys.org/news/2023-05-reve-
limeraz transkripsiyon işlemi sırasında DNA hasarlarını genom bütünlüğünü korumak için RER yolu tarafından ortadan kaldırılır, al-dna-mechanism.html / Evgeny Nudler, RNA Poly-
da tespit ediyor. Bu keşif, bir DNA onarım aracı olan ancak RNaseHII'nin nispeten nadir görülen ribonükleotid lezyonlarını merase Drives Ribonucleotide Excision DNA Repair in
nükleotid eksizyon onarım (NER) kompleksinin bir araya sağlam hücresel DNA kodları "okyanusu" arasında nasıl bu kadar hızlı E. coli, Cell (2023).

Labmarkershop.com Türkiye’nin En Büyük ONLINE Laboratuvar Alışveriş Sitesi